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病毒性關節炎
本病毒為不具封套的雙股RNA病毒，血清型與病原型 (pathotype) 眾多，對熱具抵抗性，於低溫下亦可長期存活；在羽毛、木屑及蛋殼上可存活至少10天，在飼料和飲水中則至少可存活10週且感染力僅輕微下降。主要標的為腸道、踝關節 (tibiotarsal-tarsometatarsal/hock joint) 和肝臟組織。然而本病毒常在健康雞隻的消化道和呼吸道分離到，因此推測來自雞的里奧病毒有80 % 以上是無致病性的，因此診斷時須注意。
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水禽小病毒感染症
小病毒為沒有封套的單股 DNA 病毒，為二十面體結構，直徑約為20-22 nm。對大部分化學物質、熱或物理消毒方法具有抗性，但使用甲醛可以輕易地使其失去活性。
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水禽環狀病毒感染症
本病在水禽主要造成生長及羽毛發育障礙，並侵害宿主的淋巴網狀組織，造成淋巴組織淋巴球流失，導致免疫抑制而使宿主受繼發性感染的機會增加。此外，本病毒可能發生次臨床性的感染 (subclinical infection)，雖然對宿主造成的不良影響很小，但其可造成生長性能降低，仍會造成不小的經濟損失。
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網狀內皮增殖症
經由感染雞隻的分泌物或排泄物污染的環境進行水平傳播，也可經由介蛋傳染或人工授精傳播。
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雛白痢
本菌為無運動性的 D 群沙門氏菌，為革蘭氏陰性，無芽孢生成，兼性厭氧，可產生內毒素，大小約為0.3-1.5 X1.0-2.5 um。適合生長在 bismuth sulfate 和 MacConkey agar 上，菌落型態呈現小而平滑、灰白色具光澤的外觀。本菌對環境抵抗力強，但對熱及消毒劑敏感。
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家禽副傷寒
沙門氏菌屬於腸內桿菌科，包含兩個主要的種，其中 Salmonella enterica 又分為6個亞種，其中只有 Salmonella enterica subspecies enterica (有超過2500種血清型) 會造成溫血動物的疾病。沙門氏菌為長形、不會產生芽孢的桿菌，為革蘭氏陰性，長度約為0.7-1.5 × 2.0–5.0 μm，多數具有鞭毛及運動性，會產生內毒素。屬於兼性厭氧菌，理想生長溫度為37 ˚C，對生長環境的要求較低。
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傳染性滑膜炎
Mycoplasma synoviae為血清型S型的家禽黴漿菌，人工培養較為困難，需使用特殊培養基且培養時間長。本病原於pH 6.8以下不穩定、對39 ℃以上溫度敏感，能耐受冰凍，但濃度會降低。在室溫下，羽毛上的黴漿菌至多可存活三天，在鼻腔內可存活12小時，但在多數其他材料上存活不會超過1天。
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球蟲症
球蟲屬於原蟲，為可以獨立生存的單細胞動物。其種類鑑別可依型態、大小、卵蓋、 顏色、對腸道不同部位之親和性、感染史及引起宿主的免疫反應而有所區分。球蟲卵囊對多種消毒劑具有抗性，但對溫度敏感，太高溫及太低溫都可使卵囊停止發育或死亡。
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火雞病毒性肝炎
火雞病毒性肝炎是火雞的急性至亞急性、高傳染性但通常為次臨床的一種疾病。該病最常發生在6週齡以下的小火雞，特徵是肝炎和胰腺炎。該病在美國一些地區較為常見，比如加州。在加拿大、義大利、法國和英國也報導過此病。
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輪狀病毒感染症
本病毒為不具封套的雙股含11個雙鏈RNA病毒，血清型與病原型 (pathotype) 眾多，對熱具抵抗性，於低溫下亦可長期存活；目前有7個確認的血清群（A-G血清群），除了禽類中的A、D、F和G群，此外還有一種潛在的新輪狀病毒，即H群。新的輪狀病毒已從許多禽類中分離出來，包括鴨子、火雞、雞、雉雞、鴿子和各種野禽。廣泛分佈於全世界。
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愛荷華黴漿菌感染症
本病可經水平和垂直傳播，且經感染後可成帶原者。水平傳播很容易透過直接接觸發生，傳播方式與Mycoplasma gallisepticum 相似，但傳播較快。通過呼吸道傳播通常可達100 %感染，但很少甚至不會發生關節病變。被感染之種火雞可經種蛋傳播，通常於感染的最初4-6週經卵傳播率較高。
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鸚鵡喙羽病
本病主要的傳播方式為水平傳播。研究中指出BFDV 可經由口腔、泄殖腔內及鼻腔內接種感染成功；鸚鵡會於排遺中排毒，鸚鵡之嗉囊灌洗液可測得病毒核酸，因此親鳥可能由餵食感染其子代，BFDV 陽性親鳥於病毒血症時期可能垂直傳染其子代。
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