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病毒性關節炎
本病毒為不具封套的雙股RNA病毒，血清型與病原型 (pathotype) 眾多，對熱具抵抗性，於低溫下亦可長期存活；在羽毛、木屑及蛋殼上可存活至少10天，在飼料和飲水中則至少可存活10週且感染力僅輕微下降。主要標的為腸道、踝關節 (tibiotarsal-tarsometatarsal/hock joint) 和肝臟組織。然而本病毒常在健康雞隻的消化道和呼吸道分離到，因此推測來自雞的里奧病毒有80 % 以上是無致病性的，因此診斷時須注意。
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大腸桿菌症
本病是由致病性家禽大腸桿菌 (avian pathogenic Escherichia coli；APEC) 所引起的局部或全身性的原發或繼發感染，包括有大腸桿菌性敗血症 (colisepticemia)、出血性敗血症、大腸桿菌性肉芽腫 (coligranuloma；Hjarre氏病)、氣囊病 (CCRD)、腫頭症候群、性器官大腸桿菌病 (venereal colibacillosis)、大腸桿菌性蜂窩性組織炎、腹膜炎、輸卵管炎、睾丸炎、骨髓炎/滑膜炎 (包括火雞骨髓炎複合症)、全眼球炎、臍帶炎/卵黃囊感染及腸炎。
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家禽霍亂
本病原可藉由家禽口腔、鼻腔、結膜和傷口侵入感染。帶菌禽之分泌物和屍體為主要傳染源，另外亦可經老鼠、空氣、飼料及水傳，但不會介蛋傳播。
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葡萄球菌症
本菌主要經由皮膚傷口或受損的黏膜侵入體內而感染，而雞隻受到緊迫因子如高溫多濕、通風不良、密飼、營養不平衡或感染其他免疫抑制疾病時，也易感染本病。
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雛白痢
本菌為無運動性的 D 群沙門氏菌，為革蘭氏陰性，無芽孢生成，兼性厭氧，可產生內毒素，大小約為0.3-1.5 X1.0-2.5 um。適合生長在 bismuth sulfate 和 MacConkey agar 上，菌落型態呈現小而平滑、灰白色具光澤的外觀。本菌對環境抵抗力強，但對熱及消毒劑敏感。
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肉毒桿菌毒素中毒症
本菌為革蘭氏陽性、絕對厭氧桿菌，可產生孢子，於自然環境中無所不在，其孢子耐熱、耐光線與耐乾燥，可於厭氧、溫暖 (10-50 °C) 及微鹼性環境下發芽。菌體本身對動物沒有病原性，在動物腸管中亦可存在，但在腸道中並不產生毒素，對動物體無害。本菌產生的毒素有很強的神經毒性，共可分為A-G七種型別，引起家禽中毒的型別主要為C型或C/D型 (mosaic type C/D)。
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傳染性滑膜炎
Mycoplasma synoviae為血清型S型的家禽黴漿菌，人工培養較為困難，需使用特殊培養基且培養時間長。本病原於pH 6.8以下不穩定、對39 ℃以上溫度敏感，能耐受冰凍，但濃度會降低。在室溫下，羽毛上的黴漿菌至多可存活三天，在鼻腔內可存活12小時，但在多數其他材料上存活不會超過1天。
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愛荷華黴漿菌感染症
本病可經水平和垂直傳播，且經感染後可成帶原者。水平傳播很容易透過直接接觸發生，傳播方式與Mycoplasma gallisepticum 相似，但傳播較快。通過呼吸道傳播通常可達100 %感染，但很少甚至不會發生關節病變。被感染之種火雞可經種蛋傳播，通常於感染的最初4-6週經卵傳播率較高。
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鴨源雞桿菌感染症
本菌為革蘭氏陰性球桿菌、兼性厭氧，有兩個生物型，其中具有β溶血性的為Gallibacterium anatis biovar haemolytica，沒有溶血性的為Gallibacterium anatis biovar anatis。自然宿主包括各種禽類，目前可於雞、火雞、鵝、鴨、雉、鷓鴣、牛背鷺身上分離出此菌，其中最適合的宿主為雞。在禽類為一常在菌，可在泄殖腔及呼吸道分離出。感染途徑目前不明，有許多研究指出其可能為伺機感染。
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丹毒
緊迫、啄羽毛、寄生蟲感染（尤其是球蟲病）、管理失當及氣候不佳等，皆可能促使發生本病。感染不同血清型，死亡率不一，同一血清型中毒力也可有很大差異。豬丹毒桿菌之毒力因子尚不明確，有研究指出與神經氨酸酶有關。所有的禽類都可以被感染，而火雞似乎最敏感。水禽的病例較為少見，病情在一個禽群中可持續數月，但每次只有一隻或少數禽隻遭受感染。
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家禽結核病
本病的病原是鳥型結核分枝桿菌(鳥型結核菌，禽分枝桿菌，M. avium)是好氧菌，不形成芽孢、無運動性的桿菌，長度約1-3μm。本菌是革蘭氏陽性菌，但是由於細胞壁富含脂質和mycolic acid，所以無法以傳統格蘭氏染色法著色。是一種具高度抵抗力的抗酸性染色桿菌，本菌可抵抗環境中高溫、寒冷、乾燥、酸鹼值的改變，很多的消毒劑皆無法殺滅，並可在土壤中存活數年之久。需藉抗酸性染色法始能觀察，乃石炭酸複紅（carbol fuchsin）經滲透過細胞壁，即使以酸性酒精也無法使其脫色，因具此特色，故稱為抗酸染色。本菌可以在25-45°C下生長，最適培養溫度是39-45°C，添加5-10%二氧化碳。有一些亞種如M. avium subsp. paratuberculosis及sylvaticum需添加mycobactin以利生長。培養基含有全蛋或是蛋黃可培養本菌，形成細小帶灰白色不連續菌落，本菌生長緩慢，需10天到3週的時間培養以形成菌落。其對熱、酸鹼及一般消毒劑抵抗力強。以5%石炭酸或陽光直接曝曬可以殺滅本菌。
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