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鴨病毒性腸炎/鴨瘟
本病毒為具有封套的雙股DNA病毒，核殼為球形，直徑約為120-200 nm。可在細胞核內增殖，形成嗜酸性核內包涵體。對環境抵抗性低。不會造成血球凝集反應。
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球蟲症
球蟲屬於原蟲，為可以獨立生存的單細胞動物。其種類鑑別可依型態、大小、卵蓋、 顏色、對腸道不同部位之親和性、感染史及引起宿主的免疫反應而有所區分。球蟲卵囊對多種消毒劑具有抗性，但對溫度敏感，太高溫及太低溫都可使卵囊停止發育或死亡。
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火雞出血性腸炎
主要經由消化道，口、眼結膜與排遺或被汙染的環境直接接觸傳染。
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潰瘍性腸炎
本菌為革蘭氏陽性、絕對厭氧桿菌，呈大型桿狀，形成之菌落為白色、圓形、突起及半透明，可產生孢子，菌體長3～4μm，寬1μm，平直或稍彎，兩端鈍圓，芽孢較菌體小，位於菌體近端，人工培養時，僅少數菌體可形成芽孢。
培養本菌需要豐富營養之培養基，嚴格厭氧。其中最適合之培養基為含0.2%葡萄糖、8%無菌馬血漿和0.5%酵母萃取物的胰蛋白酶磷酸鹽瓊脂；最適生長之pH值為7.2；最適生長溫度為35～42℃。
本菌能形成芽孢，因此對外界環境有很強的抵抗力。芽孢對化學消毒劑及環境變異抵抗力很強。其生長在卵黃培養物中，在-20℃下能存活16年，70℃能存活3小時，80℃可存活1小時，而在100℃時僅能存活3分鐘。腸梭菌在厭氧條件下培養的純培養物具有極高的致病性。
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壞死性腸炎
本病由感染產氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)製造的毒素所引起。一般在土壤、淡水及正常禽類的腸道和家禽的排遺中可發現產氣莢膜梭菌，所以不認為壞死性腸炎本身是一種傳染性疾病。產氣莢膜芽胞梭菌本為禽類腸道的常在菌叢之一，與複雜的其它菌叢生態共同組成腸道的環境。產氣莢膜梭菌可見於健康家禽的小腸部位，但是並不會致病。通常需要一項或更多之危險因子才會使本菌侵入宿主並存活，這些因子包括不清潔的環境、批次間之污染去除不完全、維生素E及硒缺乏、其他疾病(例如包涵體肝炎、傳染性華氏囊病)、雞隻日齡(與免疫和抵抗力有關)、腸粘膜之障礙(例如球蟲病及其他感染症、飼料) 、腸蠕動降低(飼料、感染症)、腸內菌叢的變化(磺胺劑、抗生素藥劑之使用、飼料添加物)、抗病力低落(環境、營養、緊迫、育種改良、感染病) 、當小腸內環境的條件發生變化時，產氣莢膜梭菌數量會增加，會產生過量毒素導致疾病發生。雞隻體內若具有高毒力或含有高菌量的梭菌菌株則會造成嚴重的感染。
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壞疽性皮膚炎
壞疽性皮膚炎是特急性、致命的細菌疾病，主要影響生長快速的雞隻，其特徵是突然發病、高死亡率和腫脹、發紅和滲出液體的皮膚病變。主要為創傷感染，此外本病亦常與雞傳染性華氏囊病(IBD)的感染有關，在幼齡雞如有做好IBD之防疫，則壞疽性皮膚炎的發生會減少。飼養管理不佳及高飼養密度都是引起本病之前置因子。
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