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家禽副傷寒
沙門氏菌屬於腸內桿菌科，包含兩個主要的種，其中 Salmonella enterica 又分為6個亞種，其中只有 Salmonella enterica subspecies enterica (有超過2500種血清型) 會造成溫血動物的疾病。沙門氏菌為長形、不會產生芽孢的桿菌，為革蘭氏陰性，長度約為0.7-1.5 × 2.0–5.0 μm，多數具有鞭毛及運動性，會產生內毒素。屬於兼性厭氧菌，理想生長溫度為37 ˚C，對生長環境的要求較低。
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球蟲症
球蟲屬於原蟲，為可以獨立生存的單細胞動物。其種類鑑別可依型態、大小、卵蓋、 顏色、對腸道不同部位之親和性、感染史及引起宿主的免疫反應而有所區分。球蟲卵囊對多種消毒劑具有抗性，但對溫度敏感，太高溫及太低溫都可使卵囊停止發育或死亡。
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包涵體肝炎
主要經由呼吸道、消化道，口、眼結膜與排遺或被汙染的環境直接接觸傳染，也可以經介卵傳播。
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鵪鶉支氣管炎
主要經由空氣傳播為主，口、眼結膜與糞便或被汙染的環境直接接觸傳染。
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家禽E型肝炎病毒感染症
本病於1991年首先在加拿大西部被報導，然後在美國、澳大利亞和歐洲被發現。
在30~72周齡的產蛋雞中最常見，在40~50周齡時的發病率最高。籠飼的來亨雞最易被感染，並且持續在飼養場中反復發生。本病常見於美國的雞群中。在美國進行的血清學研究顯示71%的雞群和30%的雞呈家禽E型肝炎病毒抗體陽性。大約17%小於18周齡的雞和大約36%的成年雞呈家禽E型肝炎病毒抗體陽性。
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鏈球菌症
鏈球菌屬於革蘭氏陽性球菌，顯微鏡下可見單一、成對或是形成短鏈，不具運動性，不形成芽孢，兼性厭氧，觸酶反應陰性，可發酵糖類。
鏈球菌抗原構造較複雜，其中存在於多數鏈球菌的細胞壁中之多糖抗原是鏈球菌分群的依據(Lancefield氏分類法)，目前將鏈球菌分為A~H、K~U19個抗原群，對人類致病者90%屬於A抗原群，本病病原則屬於C抗原群。鏈球菌對外界環境的抵抗力不強，對乾燥、濕熱較敏感，一般常用的消毒劑即可將其殺滅。
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